的比较鸡骨草和毛鸡骨草转录组信息，获得两者比较转录组学的差异。方法利用Illumina HiSeqTM 4000 高通量测序平台对鸡骨草和毛鸡骨草嫩叶样品进行转录组测序；将基因序列与蛋白库作blastx 比 对，通过预测编码蛋白框获得编码蛋白和蛋白序列；使用blastp 和OrthoMCL 软件联用法找出物种间的特有基 因和同源基因，开展特有基因KEGG 和GO 富集分析、单拷贝同源基因分析。结果鸡骨草和毛鸡骨草分别检 测出18 073、17189 个特有基因，同源基因有37881 个。特有基因KEGG 富集分析发现，鸡骨草的核糖体途 径富集基因数量最多且差异最显著，毛鸡骨草中ABC 转运蛋白和胞吞作用途径等显著性富集，植物-病原互作 在两个物种间都呈现显著性富集；GO 富集分析中发现，鸡骨草的胞吞作用调节、囊泡介导的转运调节、核糖 体等显著富集，毛鸡骨草中的微管结合复合物、细胞骨架、细胞膜和蛋白磷酸化作用呈现显著性富集。近缘物 种比对分析结果显示鸡骨草和毛鸡骨草的物种亲缘关系极为相近。此外，鸡骨草和毛鸡骨草分别发现了2 102、 1 794 个简单重复序列（SSR），两者出现频率最高的串联重复单元都为AG/CT。结论研究揭示了鸡骨草与毛 鸡骨草在转录组学上的异同，两者具有极为接近的亲缘关系，而特有基因差异揭示了两者在生物代谢、信号传 导、发育和功能等方面又存在不同，研究结果将为两者在栽培、生物调控和品质等方面的后续研究奠定基础。

R282.1

广东省自然科学基金项目（2018A030313312）。